Факультет цифровой экономики был основан 1992 году  на базе факультета прикладной математики СамГУ. Открытие нового факультета было обусловлены новыми стратегическими задачами общества, такими как подготовка высококвалифицированных кадров – экономистов, обладающих знаниями в области рыночной экономики.  Факультет получил самостоятельное развитие как отдельная структура в 1997 году по инициативе проф.К.С.Саидова, который в последствие вырастил целую плеяду ученых- профессоров, таких как Р.А.Сейтмурадов,  Н.У.Арабов, Б.Ш.Сафаров, Д.А.Насимов, Б.Х.Тураев.   
Под руководством первого декана проф.К.Саидова факультет получил широкую известность благодаря установлению  международных связей. Учебный процесс был налажен по программе академической мобильности. Были приглашены профессора с вузов США и Европы. Занятия проводились на английском языке, что позволило многим выпускникам  в будущем трудоустроится в лучших компаниях мира. Ахмедов Эрач работает экспертом Fitch Ratings в США, Буранов Тимурмалик работает менеджером в BAT (Великобритания, Россия). Кроме того многие иссследователи получив гранты и закончили докторантуру в Европе (Ф.Ниёзов -Дания, Д.Багиров - Великобритания).  В связи с социальной направленностью рыночной экономики в 2011 году название факультета было изменено на «Социально-экономический». В целях оптимизации структуры вуза и обеспечения реализации решения Ученого совета Самаркандского государственного университета от 6 июля 2018 года приказом ректора вуза № 584 от 24 июля 2018 года факультет был переименован в факультет «Экономики и бизнеса».
За 28 лет функционирования факультета научный потенциал поднялся выше 60%. Причем средний возраст остепенённости профессорско-преподавательского составил 45 лет.   На факультете цифровой экономики открыты 3 направления магистратуры – Цифровая экономика, Управление человеческими ресурсами, Экономическая теория. Благодаря магистратуре многие получили возможность продолжить исследовательскую деятельность в стенах родного факультета.  Кроме того, ежегодно бакалавры факультета занимают  призовые места на республиканских олимпиадах и конкурсах, также становятся лауреатами государственных стипендий А.Навои и И.Каримова (С.Султанов, И.Умиров, Х.Хасанов). 
Факультет экономики и бизнеса поддерживал научно-культурные связи с Пражским университетом Чешской Республики и Чешским университетом естественных наук, Гранадским университетом в Испании, Делийским университетом имени Дж. Неру в Индии, Высшей школой экономики в России, Пермским университетом, Казанским федеральным университетом, Минским радиотехническим университетом в Беларуси, Томским университетом экономики. 
Начиная с 2018-2019 учебного года, с учетом потребностей в подготовке специалистов, в соответствии с требованиями экономики, на факультете открыта магистратура по направлению 5А231701 - Управление персоналом, также с 2019-2020 учебного года открыта магистратура по специальности 5A234101 - Цифровая экономика.
Постановлением Ученого Совета Самаркандского государственного университета № 16 от 16 июня 2020 года в целях выполнения Постановления № ПФ-5953 «О Государственной программе в Год науки, просвещения и цифровой экономики», и координации будущей деятельности в этой области, факультет Экономики и Бизнеса был переименован в факультет Цифровой экономики. На факультете функционируют три кафедры «Управление человеческими ресурсами», «Цифровая экономика» и «Экономика отраслей».
Таким образом, в 2020-2021 учебном году на базе международных образовательных программ, организованных по инициативе факультета цифровой экономики совместно с зарубежными высшими учебными заведениями, были открыты следующие  направления совместных программ:
Степень бакалавра:
- Цифровая экономика (по отраслям и секторам);
- Экономика (по отраслям и секторам);
Степень магистра
- Корпоративные финансы и рынок ценных бумаг (по отраслям),
- Управление человеческими ресурсами
В перспективе высокий уровень остепененности профессорско-преподавательского состава позволит открыть совет по защите докторских диссертаций. Факультет развивает корпоративные отношения с крупными объектами бизнеса как SAG UzBAT, UzAVTO, Beeline, что обеспечивает  трудозанятость  для выпускников факультета